La calibración solamente es pertinente para algunas aplicaciones de precisión máxima, como telescopios astronómicos. Las lecturas de un IncOder se almacenan y comparan con una tabla de referencia en el sistema huésped. Dicha disposición anula las imprecisiones fruto de la no linealidad inherente o tolerancias de instalación. La resolución y la repetibilidad no se ven afectadas por la calibración.